Neon Genesis Evangelion - ANIMA est un light novel qui prend place dans un futur alternatif dans le monde d'Evangelion où le Plan de Complémentarité de l'Homme, vu dans les épisodes 25 et 26, n'a jamais été activé.

Trois années se sont écoulées depuis les événements du Plan de Complémentarité de l'Homme. Shinji, Asuka et Rei ont maintenant 17 ans et sont membres de la NERV JAPAN.
Leurs amis Hikari, Tôji et Kensuke sont aussi devenus des agents au sein de cette nouvelle organisation.

La NERV JAPAN se compose en grande partie des anciens membres de la NERV, elle lutte maintenant contre la SEELE qui essaie de recréer le Plan de Complémentarité de l'Homme.

 

TOME 1

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Grâce aux informations de Ryôji Kaji, la NERV est au courant du plan d'invasion par la SEELE. La NERV accélère les réparations de l'Unité-00 et la régénération de l'Unit-01.

Alors que le combat contre les Mass Production Evangelion fait rage pour Asuka pilotant l'Unité-02, Shinji et Rei apparaissent au moment crucial. Aux commandes des Unité-01 Type-F et Unité-00 Type-F, ils arrivent ensemble à repousser leurs ennemis.

Les combats s'intensifient et une mystérieuse Evangelion noire apparaît sur la Lune dans la Mare Crisium. Les affrontements se déplacent dans l'espace avec des Evas adaptées à la lutte spatiale.

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TOME 2

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La Lance de Longin est en orbite autour de la Terre et apporte de nombreuses calamités. La Sphère de Longin créée par la Lance a commencé à compresser la Terre et l'agitation des plaques tectoniques provoque de nombreux tremblements de terre qui causent beaucoup de victimes.

Pour terrasser l'Eva noire Amaros à la surface de la Lune, la NERV envoie Asuka avec son Eva Unité-02 Allegorica et Rei Cinq.

Après ce combat tragique une mystérieuse Unité-02 blanche descend des cieux. Le pilote à l'intérieur est Hikari Horaki. Shinji et Toji sont perplexes et surpris car ils n'ont aucune idée de qui est arrivé à Hikari.

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TOME 3

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La Terre est désormais exposée à un désastre sans précédent à cause d'Almarros et La Lance de Longinus... Tout le monde craint un "Reset" et le déclenchement d'un nouveau "Plan de Complémentarité de l'Homme".

Même en défiant Almarros en Afrique du Nord, Shinji et sa Super Eva ont été vaincu par leur propre "Core".

Asuka, qui avait fusionnée avec son Eva et était devenue "Crimson A1" (une Eva humanisée avec une conscience) est enfin sauvée et de retour.
Deux des Ayanami, Ayanami Trois et Ayanami Quatre, sont perturbées par des questions sur leur existences.

Le jeune Ikari Shinji, âgé de 17 ans, aux commandes de sa Super Evangelion, pourra-t-il vaincre cet ennemi alors que tout semble perdu ?

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TOME 4

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Shinji, Ayanami, Asuka et Mari se réunissent alors que tout est au plus mal. La Terre est frappée par des désastres de plus en plus forts sous l'influence de la Lance de Longin et de la Lune. Les débris issus de la croute lunaire frappent la Terre en causant des impacts de 400 km de diamètre.

Shinji, aux commandes son Eva 01 type F, et Ayanami, avec son Eva No. 00 type F, doivent lutter contre un nouvel Ange.

Asuka suivie de Mari partent lutter contre la Seele.

Les découvertes de Ryoji à propos de la Lance de Longin pourront-elles changer le cours des événements ?

Est-ce que Shinji s'en sortira alors que la situation est désespérée ?

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TOME 5

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Le substrat rocheux géant "Yomotsuhirasaka" qui a volé de la Lune à la Terre à atterri dans le Pacifique près du Japon.

Le Ultrabeads d'Hikari a vaincu le géant noir Almaros, Super Evangelion et Shinji ont réglé l'arrivée sur Terre du bloc rocheux en toute sécurité, et la crise aurait dû être évitée.

Cependant, personne n'a encore remarqué qu'il existait une loi, le géant qui a vaincu Almaros devient le prochain Almaros et Hikari à commencé à être absorbé.

Le train de la ruine recommence à bouger.